Der tropische Regenwald El Yunque National Forest bietet ein äußerst artenreiches Ökosystem mit 240 üppigen Baum- und Straucharten sowie zahlreichen Wasserfällen, Flüssen, Bächen und Strömen. Reisende wandern tief in den Wald hinein und tauchen dabei in die natürlichen Landschaften und das beeindruckende Terrain ein.
Im grünen Gestrüpp entdecken die Wanderer endemische Arten und begegnen einheimischen Tieren wie dem puerto-ricanischen Papagei, grünen Mangovögeln und dem Nationaltier Puerto Ricos, den Coquí-Pfeiffröschen, aus deren gelegten Eiern keine Kaulquappen, sondern gleich winzige Fröschlein schlüpfen. Ihren Namen verdanken sie ihrer kräftigen Stimme, denn der zweisilbige Pfiff des Männchens klingt wie „ko-qui“.
Beliebte Wanderwege im El Yunque National Forest sind der El Yunque Trail, der zum Gipfel des El Yunque Berges führt und der La Mina Trail, der einen Wasserfall hat. Es wird empfohlen, bequeme Schuhe zu tragen und ausreichend Wasser und Insektenschutz aufzutragen bzw. mit sich zu führen. Wanderer sollten auf jeden Fall grundsätzlich auch die Wettervorhersage und die Wanderbedingungen vor Beginn einer Wanderung überprüfen, da der Regenwald während der Regenzeit rutschig und unberechenbar sein kann.